Alpan Bek lisans ve yüksek-lisans eğitimini Bilkent Üniversitesi Fizik Bölümü'nde almıştır. Prof. Atilla Aydınlı danışmanlığında "düşük boyutlu sistemlerin optik özellikleri ve tümleşik fotonik devreler" üzerine çalışmıştır. Doktora çalışmasını Almanya’da Max-Planck Katıhal Araştırma Enstitüsü'nde yapmış, derecesini İsviçre’de EPFL’den 2004 yılında almıştır. Doktorasında 5 nm optik çözünürlükte "açıklıksız taramalı yakın alan mikroskobu" geliştirmiştir. Doktora sonrası Ludwig-Maximillian Münih Üniversitesi'nde nano-plazmonik sistemler ve Trieste'de Moleküler Biyotıp Enstitüsü'nde uç artırımlı Raman spektroskopisi üzerinde çalışmalar yürüttükten sonra 2011’de Türkiye'ye Orta Doğu Teknik Üniversitesi Fizik Bölümü'nde öğretim üyesi olarak dönüş yapmıştır. Burada araştırmalarını kurduğu Nano-Optik Araştırma Laboratuvarı’nda “çevre fotoniği” üzerine sürdürmektedir. Bilim Akademisi üyesi ve 2013 BAGEP ödülü sahibidir.